GMP厂房的建筑布局上一般在厂房外设置一环形密封走廊，它使洁净区与外界有了一个缓冲地带，能够防止外界污染同时也相对节能；厂房内门窗宜于内墙面平整，不设置窗台，外窗的层数设置和结构形式要充分考虑对空气水分的密封，使污染粒子不易从外部渗入。为防止室内外温差而产生结露，室内不同洁净度的房间之间的门窗缝隙要密封；门窗材料应选择耐侯性好，自然变形小，制造误差小，气密性好的，造型要简单，不易积尘，便于清扫，门框不设门槛；外墙上的窗宜与内墙面平整，窗台呈斜角或不留窗台，且为双层固定窗以减少能量损失。地面应用平整，无缝隙，耐磨耐腐蚀，不易集聚静电的，便于清理的整体地面；设计中可以采用现浇水磨石地面，所用石子直径应在6-15之间，其中分隔条必须采用铜条分隔，不得采用玻璃条。
环氧自流坪地面，它是一种树脂类复合材料地坪；它的特点是无溶剂、无味、无接缝、自流找平，可以达到镜面装饰效果、无缝连接、耐油类及酸、碱、盐化学溶剂；具有防静电、发尘小、耐磨耐冲击等特点。GMP厂房为了保证室内清洁，所有送风管，灯具必须布置在技术夹层里，现在大多数制药企业采用彩钢夹心板密封吊顶；彩钢夹心板具有重量轻，整体强度大，整体性好，保温隔热发尘小等特点，比较适用于GMP生产厂房，但是吊顶的固定必须与结构主体相连，不能与设备、管线支架混用；吊顶与墙面要光滑连接，吊顶与送回风管口要可靠封闭，吊顶安装完成后要进行灯检，保证无缝隙；根据工艺要求，一般在技术夹层内应设置检修走道，便于管道的检修和更换过滤器，技术夹层的墙面与天棚需刷涂料饰面。GMP厂房对空气的温度，湿度洁净度要求较高,要根据工艺要求，生产洁净度级别合理选用建筑材料，考虑耐火性能，从而达到GMP设计要求
