潮汐苗床灌溉系统中的潮汐分为涨潮和退潮两部分。涨潮部分:在每一个栽培床的旁边配置输送管道每一根管道都配有电磁阀。灌溉控制器控制电磁阀开启后，营养液就可以从施肥系统通过管道输到栽培苗床上。涨潮需要在规定的时间内完成，此时电磁阀处于闭合状态。退潮部分在涨潮工作完成后进行:植物经过灌溉后，回液调节阀开启，营养液被回收到沉淀小水池内，再由灌溉控制器控制水泵启动将营养液抽回到回收水箱中。
灌溉更为均匀，潮汐式灌溉是采用从植物底面给水给肥的方式，和喷淋等植物头上灌溉方式相比，不易发生头上灌溉经常会出现的苗床周边的植株得到的水肥较少的不均匀现象;同时能稳定根部介质水气含量，避免毛细根因靠近容器边部及底部干旱而死。