柔性防水套管防水层损坏的原因有以下几点：
1、防水材料使用不当造成的损坏。包括防水层选用的材料指标不符合要求，施工厚度不够；流程不当；两种或两种以上防水材料使用不当影响彼此的防水效果等。
2、在外防、外贴法施工中，柔性防水套管的防水保护层破损或变形会影响防水层的局部破损。通常，地下室墙体的柔性防水层采用结构混凝土施工，然后采用外墙反粘贴法施工。其优点是柔性防水层可以更好地与结构混凝土结合，但目前的方法大多只在防水层外砌砖。当地下室有较大沉降或回填施工时，防水层外的砖保护层可能发生变形、断裂或振动，导致防水层局部损坏。
3、柔性防水层的薄弱环节在地下水的作用下被切断，形成整体柔性防水层的破坏，使水渗入防水层。地下室各向阳角线防水层易切割。地下室楼层通常沿向阳角线有1-2条线。螺纹的防水能力比较差，这部分在结构沉降时很容易被割断。另外，地下室地面柔性防水层采用外反内粘结的方法施工，但这种方法不能使防水层与结构层粘结紧密，柔性防水层容易与结构层剥离。底板变形时的底板。结构的防水层在地下水的作用下很容易爆裂。
4、柔性防水套管防水层根据混凝土缺陷穿孔破坏。这是由于结构不均匀沉降和较大裂缝导致柔性防水层破坏；其次，采用外反内粘结法施工的地坪混凝土，外部空隙较大，此时人们不了解也无法修复混凝土。发生防水层背衬的脱落，在水压作用下，小部分防水层被破坏。
