鉴于鸡的生理特点，鸡摄入的饲料并没有完全消化吸收，约有40％－70％的营养物被排出体外，因此鸡粪在所有禽畜粪便当中养分是的。但是鸡粪不被处理或腐熟而直接施用到作物上，则存在很大的害处及隐患：直接施在土壤中，在合适条件下发酵并产生大量的热量，烧毁作物根系。同时鸡粪本身带有大量病菌，给作物带来病害隐患。因此须将鸡粪进行无害化处理和完全腐熟后才能施用于作物。? ????传统方法是将鸡粪密封堆沤，进行厌氧发酵，一般要3－4个月才能腐熟，现在通过生物技术，采用好氧发酵，腐熟速度比传统的快10－20倍，将鸡粪的蛋白质等大分子分解成小分子，作物可直接吸收。腐熟完全的鸡粪已基本闻不到臭味。 这主要是由于微生物可以将不含氮、硫的有机物质如苯酚、羧酸、甲醛等被分解为CO2和H20；将含氮的有机物氨化为NH3，NH3可被亚硝化细菌氧化为NO2-，再进一步被硝化细菌氧化为N03-；含硫的恶臭物质经微生物分解释放出H2S，被硫氧化细菌氧化成为硫酸等，使污染物得以去除。? 四、酶活性变化。鸡粪堆积发酵过程中的一切生物化学过程都是在酶的参与下进行的，酶活性大小反映了有机物料堆制中各种生物化学过程的强度。接种微生物菌剂的鸡粪堆肥，由于菌剂中含有较多产纤维素酶、蛋白酶、脂肪酶和过氧化氢酶等酶的微生物。因此，其各种酶活性显著高于自然堆制。? 五、增加肥效。微生物可以分解鸡粪中的淀粉、脂类化合物、半纤维素和蛋白质等较易分解的物质以及部分纤维素和少量木质素，其中部分转化为水溶性碳、氮化合物，同时初期被微生物利用的部分碳、氮源随着微生物的死亡而被逐渐分解释放。 有机肥不是要不要发展，而是如何加快发展的问题。我国农民有施用有机肥的传统，也有越来越多的农业废弃物资源可供用于有机肥开发。我们完全有条件大幅度提高有机肥的施用比例，实现农业的可持续发展。? ??2003年我国农田养分总投入量为6000万t左右（折合到45%无机复合肥为133亿t）。如果农田养分总投入量在我国人口与农业产量达到峰时提高到10000万t（折合到45%无机复合肥为222亿万t），若保持目前化肥与有机肥比例（有机肥料占25%），化肥所提供的总养分量将达到7500万t（折合到45%无机复合肥为167亿t），我国的农田将不堪重负，如果将有机肥比例提高到50％，化肥用量将只有小幅度增加(养分投入由4411．6万t增加至5000万t)。