50年代初期，南沙群岛一度防守真空；稍后，因菲律宾挑衅，台军再次进驻太平岛
国共内战的胜负尘埃落定后，南沙群岛经历了一段防守的真空期。1950年6月，国军撤守海南岛，西沙、南沙群岛的驻军也随之撤往了台湾。周边国家遂开始觊觎南海诸岛。甚至连法国人都试图介入。据美国中情局文件，“大概从年这段时期里，南沙群岛显然完全无人定居。最近几年利用过群岛的只有过路的中国人，还有可能的就是已在此作业多年的菲律宾渔民。然而在1956年的早些时候，有人曾发现在南威岛上飘扬着一面法国旗帜。……”省略号处，是两段未解密的内容。同年，菲律宾人克洛马，也宣称自己“发现”了无主岛屿，将属于南沙群岛的部分岛礁命名为“卡拉扬群岛”。
台湾方面很快做出了回应，在宣示“主权”的同时，成立“南沙守备区”，恢复了对太平岛的驻军。此外，还在南子礁、中业岛等岛礁上重新树立国碑，定期巡视。据中情局文件，“从年夏天，唯一已知的由国家出面的占领行为就是国民党中国在太平岛驻军，可能现在部队的全部编制约有600人。……”省略号处，有数句内容未解密。
就经济、军事层面而言，太平岛距离高雄有1700多公里，价值相对有限。但退守台湾后，国民党当局仍以“中国唯一合法代表”自居，通过维护对南沙群岛的主权，来“向海内外华人显示中华民国政府具有保卫国土，抵抗外国侵略的正当性”，确有不小的政治价值。④故此，台湾当局至今驻军太平岛。