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认定申报高新技术企业，可依照《企业所得税法》及其《实施条例》、《中华人民共和国税收征收管理法》以下称《税收征管法》及《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》以下称《实施细则》等有关规定，申请享受税收优惠（企业所得税减免10%）政策，另外政府部门会有一些相应的奖励政策，一般补助20－50万不等，如安徽省一次性奖励20万元，并发放高新技术企业认定证书（有效期三年）。
一、法规依据：
根据《中华人民共和国企业所得税法》、《中华人民共和国企业所得税法实施条例》、《高新技术企业认定管理办法》。
二、申报条件：
1、产品服务属于《国家重点支持的高新技术领域》规定的范围；
2、在中国境内不含港、澳、台地区注册的企业，近三年内通过自主研发、受让、受赠、并购等方式，或通过5年以上的独占许可方式，对其主要产品服务的核心技术拥有自主知识产权。 企业拥有1项发明专利或者6项实用新型专利（商标与外观专利不算，软件著作权等同于实用新型专利）
3、具有大学专科以上学历的科技人员占企业当年职工总数的30%以上，其中研发人员占企业当年职工总数的10%以上；
4、企业为获得科学技术不包括人文、社会科学新知识，创造性运用科学技术新知识，或实质性改进技术、产品服务而持续进行了研究开发活动，且近三个会计年度的研究开发费用总额占销售收入总额的比例符合如下要求：
a. 最近一年销售收入小于5,000万元的企业，比例不低于6%；
b. 最近一年销售收入在5,000万元至20,000万元的企业，比例不低于4%；
c. 最近一年销售收入在20,000万元以上的企业，比例不低于3%。其中，企业在中国境内发生的研究开发费用总额占全部研究开发费用总额的比例不低于60%。企业注册成立时间不足三年的，按实际经营年限计算；
d. 高新技术产品服务收入占企业当年总收入的60%以上；
e. 企业研究开发组织管理水平、科技成果转化能力、自主知识产权数量、销售与总资产成长性等指标符合《高新技术企业认定管理工作指引》的要求。
三、申报材料：
1、 高新技术企业认定申请书；
2、 企业营业执照副本、税务登记证复印件；
3、知识产权证书独占许可合同、生产批文，新产品或新技术证明查新材料、产品质量检验报告、省级以上科技计划立项证明，以及其他相关证明材料；
4、企业职工人数、学历结构以及研发人员占企业职工的比例说明；
5、经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用情况表实际年限不足三年的按实际经营年限，并附研究开发活动说明材料；
6、经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限以及技术性收入的情况表。
四、申报程序
1、企业自我评价。企业应对照《认定办法》第十条的规定进行自我评价，认为符合条件的，按照本通知要求进行申报；
2、网上注册、申报。企业登录“高新技术企业认定管理工作网，进行注册登记，并按要求在网上填写申报材料；
3、税务审核。企业将申报材料报征收企业所得税的主管税务部门审核，由主管税务部门在企业基本信息表上盖章；
4、地方初审。各市科技局（含广德县、宿松县，下同）会同财政局、国税局、地税局对辖区内企业申报材料进行初审，并形成初审意见；
5、报送材料。各市认定工作机构须正式行文上报材料。上报文件和高新技术企业申报汇总表（格式见附件3）须加盖科技局、财政局、国税局、地税局公章，连同辖区内企业申报材料（一式二份），由各市科技局在材料报送截止时间前，统一报送至省政务中心科技厅窗口。
五、申报时间和材料报送地点
新的高新技术企业认定是从2008年开始的，2008年有四批认定，2009年有三批认定，2010年只有两批认定，2011年有两批认定，2012年有两批认定（上下半年各一次），2013年高新技术企业认定申报有两批。
高新技术企业认定网上申报工作常年接受申请，各市集中初审和，省认定办分批组织评审和报送备案。2012年的高新技术企业申报截止时间分别为4月20日和8月10日。
2013年的高新技术企业申报截止时间分别为4月20日和7月20日。
附录一：
高新技术企业认定具体评价方法：（须70分以上，不包含70分）
1 核心自主知识产权 30
2 科技成果转化能力 30
3 研究开发的组织管理水平 20
4 成长性指标 20
合计 100
上述的评分具体内容包括如下:
一．核心自主知识产权（30）
企业拥有的专利、软件著作权、集成电路布图设计专有权、植物新品种等核心自主知识产权的数量（不含商标）。
[说明]
1.由专家对企业申报的核心自主知识产权是否符合《工作指引》要求进行评判。
2.同一知识产权在国内外的申请、登记只记为一项。
3.若知识产权的创造人与知识产权权属人分离，在计算知识产权数量时可分别计算。
4.专利以获得授权证书为准。
5.企业不具备核心自主知识产权的不能认定为高新技术企业。
注：如果要拿到30分，必须要有6个软件著作权登记证书或者1个发明专利或者6个实用新型专利。
二．科技成果转化能力（30）
最近3年内科技成果转化的年平均数需四项以上
[说明]
1.同一科学技术成果（专利、版权、技术使用许可证、注册的软件版权、集成电路布图设计）在国内外的申请只记为一项。
2.购入或出售技术成果以正式技术合同为准。
3.此项评价可计入技术诀窍，但价值较小的不算在内。从产品或工艺的改进表现来评价技术诀窍等的价值大小（企业可以不披露具体内容）。
4.技术成果转化的判断依据是：企业以技术成果形成产品、服务、样品、样机等。
科技成果转化证明材料：包括成果来源说明及成果所形成的产品、服务、样品、样机的说明。
可提供证明材料：县级以上的科技计划立项（验收）文件、专利证书或者受理通知书，软件著作权、查新报告、检测报告、产品鉴定证书或高新技术产品、国家新产品认定证书、与其它企业或高校的技术开发合同、项目验收报告（生产批文、生产登记批准书）、测试报告、企业标准备案证明、产品销售合同发票或订单（用户使用报告）、产品照片、发表论文（供参考）。
成果来源的可以考虑提供的材料：如三年内购入或出售技术成果的正式技术合同、近三年研发项目编号（取自申报表中二项目编号）、三年之前的成果、专利等
成果形成的产品可考虑提供的材料：如新产品证书、新产品检测报告、新产品新技术鉴定验收证书、新产品查新报告、新产品销售证明、生产登记批准书等
成果形成服务可考虑提供的材料：如销售合同、发票、用户意见、收入证明等。
成果形成样品、样机可考虑提供的材料：如检测报告、实物照片等。
备注：一项新产品可能是多项科技成果的转化结果，可逐一填写。
三．研究开发的组织管理水平（20）
（1）制定了研究开发项目立项报告;（2）建立了研发投入核算体系；（3）开展了产学研合作的研发活动；（4）设有研发机构并具备相应的设施和设备；（5）建立了研发人员的绩效考核奖励制度。
注：以上五个小项全部齐全后，才能拿到20分
四．总资产和销售额成长性指标（20）
此项指标是对反映企业经营绩效的总资产增长率和销售增长率的评价（各占10分），具体计算方法如下 ：
总资产增长率＝1/2 （第二年总资产额÷第一年总资产额＋第三年总资产额÷第二年总资产额）－1。
销售增长率＝1/2 （第二年销售额÷第一年销售额＋第三年销售额÷第二年销售额）－1；
注：总资产和销售每年是递增的，才能达到20分
附录二：
申报认定国家高新技术企业的好处：
1、高新技术企业认定申报成功后，可以享受企业所得税减免10%的优惠政策，即根据国家新税法：高新技术企业享受15％的企业所得税（非高新技术企业所得税税率为25％）。
2、高新技术企业认定申报成功后，各地政府根据当地实际情况，给予企业一定的资金补助，促进企业发展。
3、高新技术企业在购买土地时候，可享受当地政府高新技术企业用地优惠政策（低于同等地价5%-25%的优惠）。
4、高新技术企业资质也是很多资助类、认定类科技项目的基础，资助类如重大专项、国内/国际合作、创新基金等，认定类如研发中心、技术中心，国家技术工程中心等，所以很多科技项目都需要具备高新技术企业资质的基础上申报。
5、高新技术企业是企业研发实力的象征，从2008年8月开始重新认定的高新技术企业，即为国家高新技术企业，其认定难度大，致使高新技术企业证书含金量高，这就能充分体现企业的实力，并且在全国都能得到认可，有利于企业的外部市场的开拓。
6、高新技术企业认定成功后，提升企业招投标资质水平，有利于企业招投标，同时高新技术企业认定也是企业上市的基础条件。
说明：
高新技术企业认定申报是一项专业性非常强的工作，如果由企业单独来操作，可能会耗费许多时间与精力而不得其所。建议可以与专业的高新技术企业认定申报代理机构合作，在他们的帮助辅导下申报高新技术企业认定，往往能收到事半功倍的效果，将大大提高新技术企业认定申报的成功率。