微波小麦胚芽干燥设备主要运用微波对食品进行辐射加热干燥杀菌，微波杀菌主要靠微波的生物效应和热效应。食品在微波的辐射下细胞膜断面的电位分布受到影响，造成细胞膜周围电子、离子浓度和细胞膜的通透性能改变，造成细胞营养不良，不能正常新陈代谢，细胞结构功能紊乱，生长发育受到抑制而死亡。
微波的热效应是物体由于吸收微波能升温，使物料的水分子升温挥发达到烘干效果；而细菌体内蛋白质同时受到无极性热运动和每秒钟24亿5千万次震荡的作用，使其空间结构变化或破坏，而使蛋白质变性，蛋白质变性后就失去生物活性。
利用微波对小麦胚芽进行干燥杀菌有以下优点：
1、时间短，速度快。一般3、4分钟即可，大大节省了时间。
2、干燥、杀菌、杀虫、防霉可同时进行，缩短了加工工艺。
3、极大程度的保证了原物料的有效营养成分，保持原有的色泽度，延长了物料的保鲜期和货架期。
4、设备简单，工艺先进，便于操作，节省占地面积，节约能源，改善劳动条件。
小麦胚芽干燥杀菌设备早就应用在农产品的深加工方面，包括食品的干燥、烘烤和杀菌处理，以便于食品运输和延长食品的保质期。所以食品行业是微波设备应用成熟的行业，在食品加热、蒸煮、熟化、烘烤、杀菌等方面，微波都可以做得到。
通过微波干燥、杀菌设备处理过的食品的保质期可延长3～8倍，并且是低温处理，不破坏食品原有的营养成份、色泽、口感和天然风味；我公司生产的微波食品杀菌设备操作简便，劳动强度低，占地面积小、能耗低，且不产生“三废”污染。
微波小麦胚芽干燥设备的应用范围很广，可对糕点、肉制品、果脯、豆制品、熟食、调味品、米粉、麦片、豆奶粉、卤菜、牛肉干、方便面、保健茶、土豆片、鱼片干、盐水鸭、海产品等杀菌处理。由于在杀菌过程中伴随有干燥效果，所以有时也用来当作食品干燥杀菌设备，也适用于对面包、糖、干果、茶叶、烟叶、粮食制品的脱水、干燥、杀菌防霉处理。