霉菌毒素对水产动物的危害多表现为隐性的，积累到一定的程度造成的损伤是不可逆的；特别严重的是霉菌毒素对水产动物免疫系统的损伤，导致养殖动物很容易继发其他病害，而且这种发病造成的损失往往来得又快又狠。
霉菌毒素对虾类的危害主要表现为：直接损伤虾的肝胰腺，造成虾的免疫系统功能丧失；继而引发虾肝胰腺坏死发生偷死以及长不快、体色差、容易发生应激、软壳等；此外，霉菌毒素还引起虾的消化道损伤，造成空肠空胃、红肠红胃，继发感染后形成肠炎、白便等。
在对虾养殖中，我们很难从根本上去避免霉菌毒素的危害，只能通过一些措施将其对水产动物的危害尽量降低。
1、养殖过程中加强管理。不过多地储存饲料，开袋的药品或饲料及时用完，已经发霉的饲料不要使用。养殖中使用的拌料工具及时清洁等。
2、保肝护肠。肝脏是对虾的解毒中心和免疫调控中心，霉菌毒素进入机体造成损伤的最重要器官也是肝脏，因此提高对虾肝脏在对抗霉菌毒素过程中解毒功能是降低霉菌毒素危害的最重要措施。护肠对于降低霉菌毒素的危害也有着重要的意义，增强肠道功能，修复肠黏膜，让肠道把吸附进去的霉菌毒素排出体外，减少霉菌毒素在体内的蓄积，减少对肠道的损伤。
胆汁酸是动物本身分泌的一种内源性活性物质，它刺激肝脏分泌大量稀薄的胆汁，并通过肝-肠循环将体内的毒素、代谢废物和饲料中的一些金属离子排除体外，起到疏通胆道，减轻肝脏压力，保护肝脏健康的作用。在虾料投喂时每吨添加1000g胆汁酸可从根本上保护对虾肝胰脏健康。
霉菌毒素无处不在，霉菌毒素的预防必须是一个细致、长期的过程，不要等到霉菌毒素在体内蓄积到相当的程度造成机体损伤严重时，才意识到霉菌毒素的危害。做好保肝护肠，及时将对虾体内的毒素清除，尽量减少霉菌毒素在体内的量才是减轻霉菌毒素危害的根本之道。