策略一、注重与各级税务机关的沟通。
虽说应对税务检查的策略是企业自身的税务风险管理，但与各级税务机关的有效沟通也是必不可少的，尤其对于规模不大的无法实施有效税务风险管理的企业。对于发起部门级别较低的税务检查，可以与属地税务部门进行沟通，了解税务检查的原因，是涉税指标异常抑或税收政策专项检查，是以税收任务为目标的检查还是以执法规范为目标的检查，除此之外，还需要了解税务检查的组成人员是哪些，是稽查人员还是普通的税收征管人员，是属地税务人员还是有外地支援的税务人员，通常，稽查部门发起和有外地支援的的税务检查都会更为严格。
策略二、关注企业自身的税务风险管理。
打铁还需自身硬，身硬还需下功夫，应对税务检查的策略还是加强企业自身的税务风险管理，通过不断地识别企业各类业务环节中的涉税风险并建立防范相应风险的内控措施，将税务检查引起的损失降低到可接受的水平。风险管理的概念对于企业(特别是大企业)来说并不陌生，其目标是保存组织生存的能力，并对客户提供产品和服务，以保护公司的人力与物力，保障企业的综合盈利能力，通过风险成本至小化实现企业价值至大化。
策略三、发挥外部税务咨询的作用。
以国际四大会计师事务所为代表的税务中介对于企业应对税务检查也是有非常积极的意义，特别是税务审计、反避税调查等方面。相对企业而言，税务中介对税收政策更为精通，对于企业可能存在的涉税风险会更为了解，对于税务机关重点关注的检查领域也会更为清晰，在权衡成本和效益的前提下，引入税务中介的咨询有利于降低税务检查可能带来的损失。在外部税务咨询的引入方面，企业也应注意以下的问题：税务中介是专业机构但不是权威机构，税收政策的解释权永远是在税务部门，因而对于特定的税收筹划措施还是有必要与属地税务部门进行沟通，规避不当税收筹划可能带来的风险。