一般产地证、普惠制产地证、亚太贸易协定证书主要区别有两点：
第一点、
一般原产地证作用是证明货物的原产国，用来确定货物“国籍”的有效证明文件，不能享受进口国减免关税的待遇。
普惠制产地证、亚太贸易协定证书不仅能证明货物原产国，还可以享受进口国进口关税减免的待遇。
第二点、
一般原产地证出口到任何国家均可办理。
普惠制产地证优惠国共36个：欧盟25国（比利时、丹麦、德国、法国、爱尔兰、意大利、卢森堡、荷兰、希腊、葡萄牙、西班牙、奥地利、芬兰、瑞典、波兰、捷克、斯洛伐克、拉脱维亚、爱沙尼亚、立陶宛、匈牙利、马耳他、塞浦路斯、斯洛文尼亚、保加利亚、罗马尼亚）、挪威、瑞士、土耳其、俄罗斯、白俄罗斯、乌克兰、哈萨克斯坦、加拿大、澳大利亚和新西兰。
亚太贸易协定优惠国有：韩国、斯里兰卡、印度、孟加拉、蒙古国共五个国家。