对于阳离子聚丙烯酰胺，由于其水溶液带有正电荷，可将含有负电荷的悬浮物迅速絮凝沉淀下来。在酸性条件下，有机物容易结合氢离子，但是其中的羟基、羧基、酰胺基等仍然有电负性，以及可以发生氢键作用，因此容易和阳离子聚丙烯酰胺作用，同时阳离子絮凝剂的季铵盐离子结合质子不是太牢固，仍和大的有机物发生作用。但酸性太强，就失去效果了。若酸性较强可以先投加聚合氯化铝，由于聚合氯化铝呈碱性可起到中和的作用，同时聚合氯化铝可将酸性废水中的悬浮颗粒絮凝成为细小的絮团，然后投加絮凝剂可以的更好的发挥絮凝沉淀作用。
在酸性和碱性较强的环境下，单独使用聚合氯化铝，认为投加聚合氯化铝等无机絮凝剂后，再投加高分子絮凝剂比较麻烦，而且聚丙烯酰胺单价较高。从表面看，聚丙烯酰胺价格较贵，但分子量高，只要选型合适，一般用量很少，且形成的絮团大、沉降速度快、出水清，其综合性价比较聚合氯化铝高。因此建议将聚合氯化铝与聚丙烯酰胺搭配使用，可以起到最优的水处理效果。