软件著作权登记证书是由国家版权局计算机软件登记办公室颁发的法律文书，是软件著作权人对所登记事项的初步证明。软件著作权可以请代理机构代为申请，也可以自己申请。如果请代理机构申请，则一切事宜都交由代理机构就可以了，只需提供相关材料，但如果考虑到安全问题或者费用问题，就可以考虑自己申请，自己申请和代理机构申请在流程上都是一样的。
现将流程列出来，供大家参考：
一、网上填写申请表
中国版权保护中心（是国家版权局认定的唯一的软件著作权登记机构，全国各地都需要在中国版权保护中心进行软件著作权登记。
1、注册用户名（用于软件著作权登记申请表的填写、修改、打印），用户名和密码一定要保存一下，以备将来办理软件著作权登记时要修改信息时所用。
软件著作权登记申请表要填写的内容包括：
A、软件全称、简称、版本号、开发完成日期、软件开发情况(独立开发、合作开发、委托开发、下达任务开发)；
B、原始取得权利情况、继受取得权利情况
C、权利范围、软件用途
D、技术特点(软件名称、用途、技术特点、开发的软硬件环境、编程语言及编程语言版本号、程序量、零售价格)
E、软件著作权拥有状态、申请者详细情况、软件鉴别材料交存方式、申请者签章。
注：乍看填报的内容挺多的，但不必担心，这些内容填写的注意事项，在网上填写表格的时候会提示大家的。
2、将填写完的软件著作权申请表打印并签章
申请表一定要在线打印，请勿擅自更改表格格式；申请表打印出来，在指定位置需签章，签章应当与申请表中填写的姓名或者名称完全一致。
二、准备材料
1、软件源程序代码（A4纸打印，单面，1份）
前、后各连续30页，共60页。(不足60页全部提交)第60页为模块结束页，每页不少于50行(结果页除外)，在每页的左侧留出装订线，右上角打印或标注页号1—60。
2、软件用户手册、操作手册、设计说明书、使用说明书等任选一种
前、后各连续30页，共60页。(不足60页全部提交)第60页为文档结束页，每页不少于30行(结果页除外)，在每页的左侧留出装订线，右上角打印或标注页号1—60。(若希望多交文档，每多交一种文档需增加文档费)，要图文并茂，软件的每个功能基本上都要涉及到。
3、身份证明
A、著作权人为个人
应提交身份证复印件一份，如有工作单位，可以要单位出具非职务软件开发证明，也可以个人出具非职务软件开发保证书。（《非职务开发证明》《非职务开发保证书》在上可）
B、著作权人为单位
企业法人或事业法人的应提交有效的企业法人营业执照或事业单位法人证书副本复印件，并需加盖单位公章；社团法人单位提交民政部门出具的有效的社团法人证书的复印件；其他组织提交工商管理机关或民政部门出具的证明文件复印件；
4、委托办理文件（用于请代理机构代为申请的情况下）
A、授权委托书
申请人委托代理人代为办理软件著作权登记申请的,应提交授权委托书。
B、受委托人身份证复印件
5、其他证明文件：
若申请者存在以下情况，需提交以下文件：
合作开发——合作开发合同书或合作开发协议书1份A4纸。
委托开发——委托开发协议书1份A4纸。
下达任务开发——任务书1份A4纸。
三、递交文件
如果申请人在北京，则将以上材料提交到中国版权保护中心，经审查无误后，受理员将在软件著作权申请书上盖章，然后到去缴费，拿到受理通知单。
如果申请人在外地，则需将以上材料邮寄到版本保护中心指定的地址，相关工作人员收到快递并审查无误后，会向申请人提供的邮箱发出缴费通知单，申请人按指定方式缴费就可以了。
四、领取软件著作权登记证书
按照规定，在取得受理通知单30个工作日可以到中国版权保护中心领取软件著作权登记证书。
大家看懂了吗？其实归根结底，可以总结为以下几句话，简洁版流程：
办理计算机软件著作权的基本流程：
1、网上申报
2、准备相关材料，打印，盖章，邮寄
3、交到中国版权保护中心
4、受理缴费（有问题的话按要求修改直至受理）
5、二审（有问题的话会发补正通知，按要求修改，直至通过）
6、公告出证，一般在网站公告3工作日后出证，一般是受理之日起30工作日出证。