生态园农业大棚温室的基础设计时，除满足强度的要求外，还应具有足够的稳定性和抵抗不均匀沉降的能力，与柱间支撑相连的基础还应具有足够的传递水平力的作用和空间稳定性。玻璃温室底部应位于冻土层以下，采暖温室可根据气候和土壤情况考虑采暖对基础冻深的影响。一般基础底部应低于室外地面0.5米以上，基础顶面与室外地面的距离应大于0.1米，以防止基础外露和对栽培的不良影响。除特殊要求外，玻璃温室基础顶面与室内地面的距离宜大于0.4米。
对于会出现连作障碍这种现象，专家认为可能与有机肥料投入不足、病虫危害、土壤不适合相关，除此之外，滥用氮素化肥而次生盐渍化严重、根结线虫病为重点的设施也成为蔬菜连作障碍。根据多年的原理，专家们发现了连作障碍防控的原理。 一、充分利用太阳、生物、化学所产生的三大热能，通过高温闷棚处理，促使耕作层土壤形成55℃以上的持续高温，这样能够有效防除致病微生物及部分地下害虫，获得局部生态防治的良性效应。
、在玻璃温室大棚中，利用高温闷棚技术，充分腐熟土壤内有机肥，提高吸收利用率;通过增加土壤有机质含量，促使次生盐渍上脱盐，能够改善土壤团粒结构，培养有益微生物群落。