微波灭菌杀虫卵机运行时首先由微波发生器发生微波，经馈能装置输入微波腔体中；木耳香菇等物料由传输系统送至腔体中，木耳香菇中的细菌则被微波电磁场作用下所产生的生物效应和热效应杀灭。由于微波是直接作用于物料，所以杀菌杀虫温度低、速度快，有效成份的损失很小，并且杀菌杀虫卵均匀、全面，提高了香菇木耳等食用菌的品质质量。
木耳香菇食用菌微波杀菌杀虫卵机是湖北敏锐微波设备有限公司针对木耳等食用菌研发生产的环保节能设备，设备用电，无需煤、燃气等燃料，不会有任何污染物排出，微波辐射穿透木耳等物料，内外同时进行，无需能量传递，基本没有能量损耗，相比其他方式的节能30%以上。工艺先进，操作简单实现自动化生产，省人工，省开支。