微波能穿透物料内部，频率为2450MHz，以每秒24亿5千万次振荡，通过特殊的热和非热效应杀死细菌，与常规热力杀菌比较能在比较低的温度和较短的时间，就能获得所需的消毒杀菌效果。实践证明，一般在70℃就可全部杀死大肠杆菌，在80～90℃细菌总数大大降低，时间只需2～3分钟。速度快，时间短，因此保留食品中的营养成份、传统风味。延长保质期，对提高产品质量有优良效果。
微波粉体烘干杀菌设备的应用特点：烘干速度快、节能、杀菌均匀、杀菌效率高，杀菌时间短；杀菌后产品的色香味稳定、不结块；另外微波杀菌设备可以与生产工序的前端和后端设备联机组成一条完整的生产线，让生产实现较高的自动化。