在开封市水利设计资质办理过程中，主导专业和非主导专业的区别主要体现在以下几个方面：
1. **专业重要性与权重**：
- 主导专业是指在水利设计项目中起到关键作用的专业，比如水工结构、水文水资源、农田水利、水土保持等。这些专业对设计成果的安全性、合理性以及工程的整体性能具有决定性影响，因此在资质申请时，对这些专业的技术人员要求更高。
2. **人员配置要求**：
- 对于申请水利设计资质的企业，主导专业的技术人员数量和职称、注册工程师资格等要求更为严格，可能需要更多高级职称和注册工程师的支持。而非主导专业的技术人员配置要求相对较低。
3. **业绩考核**：
- 主导专业的注册工程师通常需要提供业绩证明，比如参与或主持过一定数量和规模的水利工程项目设计，并且这些业绩要符合资质申请的标准。而非主导专业的技术人员可能对业绩要求相对宽松，或者不需要提供业绩证明。
4. **对资质等级的影响**：
- 不同级别的水利设计资质申请，主导专业的人员配置要求会明显影响资质申请的成功与否。企业在申请资质时，主导专业的人员配置不足或不符合要求，可能导致资质申请不能通过。
综上所述，主导专业在水利设计资质办理中扮演的角色更为关键，其人员配备和技术实力直接决定了企业能否成功获得相应的资质等级。非主导专业虽然也是资质申请的重要组成部分，但其要求相比主导专业可能相对宽松一些。在实际办理过程中，应严格按照国家及地方的水利设计资质标准进行操作。