河南农业综合开发生态乙级资质与水利设施建设之间存在紧密的关系，这种关系体现在以下几个方面：
资质要求的相互补充：获得农业综合开发生态乙级资质的企业或机构，通常需要具备包括水利工程师在内的多专业工程师团队，这意味着它们在进行农业综合开发项目时，有能力自行设计或监督水利设施建设。水利设施，如灌溉系统、排水系统、小型水库、水土保持工程等，是农业综合开发中的基础组成部分，对于保障农田灌溉、防洪排涝、水资源合理利用至关重要。
生态理念的融合：在农业综合开发中，生态乙级资质强调的是在水利设施建设中融入生态保护和修复的理念。这要求在水利设施设计与施工时，充分考虑对生态环境的影响，比如通过采用生态友好型材料、设计生态渠道、实施水土保持措施等，减少对自然生态系统的破坏，促进生态平衡。
水资源管理：乙级资质持有者在水利设施建设中还需考虑水资源的高效管理和可持续利用。这包括水资源的合理调配、节水灌溉技术的应用、水质保护等，确保农业用水的同时，不影响周边地区的水资源供给和生态需求。
法规遵循与标准执行：资质要求企业或机构严格遵守国家和地方关于水利设施建设的法律法规，如《中华人民共和国水法》、《农田水利条例》等，确保水利设施的建设符合安全、环保、经济的标准。
技术支持与创新：乙级资质往往意味着在水利设施建设中能够采用较为先进的技术与方法，如智能灌溉系统、遥感监测技术、GIS在水资源管理中的应用等，提升水利设施的科技含量和管理效率。
综上所述，河南农业综合开发生态乙级资质与水利设施建设之间的关系，是基于共同促进农业现代化、生态化、可持续发展的目标，通过专业技术、生态理念、高效管理的综合应用，确保水利设施成为农业综合开发中的坚实支撑。