生物除臭设备装置原理是以生物填料为载体，使微生物在适宜的环境下，在生物填料表面形成生物膜，生物膜中的微生物利用废气中的无机和有机物作为碳源和能源，通过降解恶臭物质维持其生命活动，并将恶臭物质分解成二氧化碳、水、矿物质等无臭物以此达到净化废气恶臭目的。
生物除臭设备装置技术是利用微生物的生理过程把有机废气中的有害物质转化为简单的无机物，（C02、H20和其它简单无机物）等，这是一种无害的有机废气处理方式。
恶臭气体经过管道收集后进入预处理装置，经水洗加湿使废气的湿度达到90%以上，湿气体再进入生物过滤除臭装置，气流与循环液在穿过生物填料层的过程中完成生物的气液扩散、液固扩散、生物氧化三个过程，生物填料表面生物膜中的微生物以恶臭气体物质为营养，恶臭物及VOCs被微生物氧化分解。在转化过程中产生能量，为微生物的生长与繁殖提供能源，使恶臭气体物质的转化持续进行，经净化后的气体由引风机引出排放。