均质完成后（均质里面有压力不需要泵），原奶进入到巴氏杀菌罐中进行杀菌和搅拌。
（4）需要杀菌时，开启连接原奶罐与巴氏杀菌罐的离心奶泵，通过350#导热油或热水/蒸汽进行巴氏杀菌，按照不同的热源、产量区分，杀菌用时一般为0.5～1.5小时左右，巴氏杀菌温度为85℃。
（5）杀菌完成后，通过奶泵将鲜奶打入到预冷罐中，预冷罐是使用冷水进行预先降温，然后打入到发酵罐中，添加相应的菌种和发酵剂，进行酸奶发酵。
（6）整体运行完成后，需要对设备进行CIP清洗，所谓的CIP清洗，全称为Clean In Place，意思是原位清洗/在线清洗。
CIP清洗既不分解生产设备，又可用简单操作方法安全自动的清洗系统，几乎被引进到所有的食品，饮料及制药等工厂。CIP清洗不仅能清洗机器，而且还能控制微生物。
CIP清洗系统，是由三个分别装有弱酸水、弱碱水、清水的储罐以及水泵、管道、阀门等组成。通过三种液体的分别循环清洗设备，使设备干净无卫生死角。原则上建议客户采用CIP清洗系统，但是CIP清洗系统造价较高，如果产量较低的话，客户也可以选择手动清洗。